Radio Kootwijk is een belangrijke schakel tussen een stuifzand- en heidegebied. Aan de noordwestzijde bevindt zich het Kootwijkerzand, de grootste actieve zandverstuiving van Nederland. Staatsbosbeheer houdt het stuifzand ‘levend’ door dichtgroeien tegen te gaan. Op een dag met flinke wind worden hier enorme hoeveelheden zand heen en weer geblazen. ’s Morgens kan het gebied er heel anders uitzien dan later op de dag.

Heide

Aan de zuidkant, rondom het zendgebouw, is open heideterrein. Bij de bouw van het zendstation is hier de bodem - met de hand! - vlak gemaakt. Ook het latere beheer was erop gericht het terrein open te houden. Dit menselijk ingrijpen heeft geleid tot schrale zandige heidegrond, bij uitstek een leefomgeving voor bijzondere flora en fauna. Bijzondere korstmossen zijn kenmerkend voor het gebied. Maar ook grassoorten die van de typische schrale heidegrond houden en op hun beurt verschillende insectensoorten aantrekken.

Eikenbomen

Bijzonder ook zijn de groepen eikenbomen van honderden jaren oud; een zeldzaamheid in dit soort gebieden waar vliegdennen domineren. Aan de buitenkant van de zogenaamde zendcirkel (rondom zendgebouw A) staan jeneverbessen. De jeneverbes is een in Nederland wettelijk beschermde struik die zich prima thuisvoelt op arme zandverstuivings- en heidelandschappen.

Dassenburcht

Edelherten en wilde zwijnen zijn vaste bewoners van het gebied van Radio Kootwijk. Ook zijn er dassenburchten. En er zijn sporen van de boommarter gevonden. In het gebied zijn verschillende broedvogels waargenomen. Naast de wespendief en zwarte specht die op de hele Veluwe voorkomen, zijn er vogelsoorten die echt typisch zijn voor het gebied van Radio Kootwijk: de boomleeuwerik, grauwe klauwier, nachtzwaluw, roodborsttapuit en tapuit. Ook reptielen hebben er hun thuis: zandhagedis, levendbarende hagedis, hazelworm, adder, ringslang en gladde slang. De gebouwen van Radio Kootwijk bieden onderdak aan acht soorten vleermuizen.